Si bien la isla está deshabitada, hay visitantes temporales (pescadores, campesinos, pescadores de langosta, turistas e integrantes de la población local) que extraen madera para mantener algunas casas presentes en la isla. Los estudios preliminares sugieren un nivel de diversidad genética reducido para los perezosos pigmeos en comparación con su supuesta población de origen, los perezosos comunes que habitan la parte continental de Panamá. Esto es esperable, teniendo en cuenta la historia de diversificación y aislamiento de especies en la isla. También se detectaron signos de un cuello de botella en la población de la isla. Estos resultados resaltan la necesidad de una evaluación continua del estado y tendencias de la población, así como de estudios adicionales que tengan en cuenta un posible escenario de depresión endogámica si el tamaño de la población (ya bajo) disminuye aún más. A pesar de haber sido designado como paisaje protegido mediante una resolución gubernamental en 2009, se han realizado una serie de esfuerzos nacionales e internacionales para desarrollar infraestructura turística en la isla. El creciente interés por utilizar la isla con fines turísticos aumenta exponencialmente el número de visitantes locales y turistas. Por otro lado, las intenciones de los indígenas locales de construir asentamientos permanentes en la isla han aumentado el número de construcciones permitidas, poniendo en peligro a los perezosos pigmeos y su hábitat.

El estado actual de la custodia de la isla es indefinido; una resolución gubernamental, y por lo tanto el estado de protección de la isla, no se puede revocar, pero no se ha designado personal gubernamental específico para hacer cumplir la protección de la isla. Los continuos desacuerdos entre la comarca local de Ngäbe bugle, los políticos regionales y el gobierno panameño están complicando aún más la protección a largo plazo de la isla y de los perezosos pigmeos. Además, a medida que los perezosos pigmeos se han vuelto más reconocidos internacionalmente, existe un creciente interés en recolectarlos para mantenerlos en cautiverio.

Esta especie se puede encontrar tanto en los manglares como en el interior de la Isla Escudo de Veraguas. Aunque anteriormente se pensaba que habitaba exclusivamente los manglares rojos de la isla, durante recientes estudios de seguimiento se han encontrado ejemplares en el interior de la isla, en la densa selva tropical. Debido a la dificultad de censar a estos mamíferos crípticos que habitan el dosel, se desconoce su densidad y abundancia en los bosques más densos. Los perezosos pigmeos son principalmente arbóreos, pero también pueden nadar y moverse lentamente en el suelo.

El perezoso pigmeo está categorizado como En Peligro Crítico debido a su área de distribución muy restringida, hallándose sólo en una isla de menos de 5 km², y porque es probable que haya una disminución continua de la calidad de hábitat y el área de ocupación por causa de la degradación del hábitat. El perezoso pigmeo está incluido en el Apéndice II de CITES.